벼 조직 단백질체 분석을 위한 시료 전처리 및 질량분석 데이터 획득 전략의 비교 평가

 

부산대학교 응용생명융합학부 그린바이오과학전공 김선태 교수 연구팀이 수행한 연구가 농업 및 식품화학 분야의 국제 저명 학술지인 Journal of Agricultural and Food Chemistry에 2026년 6월 게재되었다.

본 연구는 벼의 잎, 뿌리 및 종자를 대상으로 4가지 시료 전처리 방법과 3가지 질량분석 데이터 획득 방식을 비교하여 식물 단백질체 분석에 적합한 고효율 분석 전략을 평가한 연구이다.

연구 결과, SP3 워크플로우는 기존 침전 기반 방법에 비해 시료 처리 시간을 약 19–22시간에서 3시간 20분으로 단축하였으며, 잎과 종자에서 높은 정량 재현성을 나타냈다. 또한 4D-DIA는 DDA보다 약 3–4배 많은 단백질을 동정하고 저함량 단백질의 검출 범위를 확대하였다.

이번 연구는 SP3와 4D-DIA를 결합한 분석 체계가 신속하고 재현성 높은 심층 식물 단백질체 분석에 효과적임을 제시하였으며, 향후 대규모 식물 오믹스 및 작물 연구에 활용될 것으로 기대된다.

 

  게재 학술지: Journal of Agricultural and Food Chemistry (JCR Top 12.63%, Q1)

  논문명: Comparative Assessment of Sample Preparation Workflows and Mass Spectrometry Acquisition Strategies for Bottom-Up Proteomics in Rice Tissues

  연구 분야: 식물단백질체학, 질량분석학, 분석화학, 식물오믹스, 작물생명공학